Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKCZQ05513 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKCZQ05513 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKCZQ05513 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKCZQ05513 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKCZQ05513 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms