Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD164Q04900 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD164Q04900 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD164Q04900 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD164Q04900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD164Q04900 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CD164Q04900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD164Q04900 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CD164Q04900 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD164Q04900 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD164Q04900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD164Q04900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CD164Q04900 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD164Q04900 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD164Q04900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD164Q04900 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD164Q04900 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD164Q04900 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD164Q04900 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CD164Q04900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CD164Q04900 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CD164Q04900 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD164Q04900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD164Q04900 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD164Q04900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CD164Q04900 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD164Q04900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD164Q04900 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD164Q04900 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms