Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RELNP78509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELNP78509 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELNP78509 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RELNP78509 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RELNP78509 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELNP78509 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELNP78509 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELNP78509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELNP78509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RELNP78509 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELNP78509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELNP78509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RELNP78509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RELNP78509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RELNP78509 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RELNP78509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RELNP78509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELNP78509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RELNP78509 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELNP78509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELNP78509 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RELNP78509 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RELNP78509 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELNP78509 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELNP78509 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RELNP78509 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RELNP78509 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RELNP78509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELNP78509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELNP78509 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELNP78509 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RELNP78509 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELNP78509 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RELNP78509 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RELNP78509 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELNP78509 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELNP78509 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RELNP78509 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RELNP78509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RELNP78509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELNP78509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELNP78509 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELNP78509 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELNP78509 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RELNP78509 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RELNP78509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELNP78509 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELNP78509 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELNP78509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RELNP78509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RELNP78509 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RELNP78509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.4 ms