Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RBX1P62877 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RBX1P62877 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBX1P62877 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBX1P62877 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBX1P62877 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBX1P62877 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBX1P62877 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBX1P62877 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBX1P62877 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBX1P62877 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBX1P62877 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBX1P62877 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBX1P62877 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBX1P62877 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBX1P62877 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBX1P62877 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBX1P62877 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBX1P62877 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBX1P62877 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBX1P62877 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBX1P62877 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBX1P62877 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBX1P62877 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBX1P62877 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBX1P62877 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBX1P62877 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBX1P62877 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBX1P62877 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBX1P62877 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBX1P62877 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBX1P62877 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBX1P62877 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBX1P62877 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBX1P62877 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBX1P62877 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBX1P62877 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBX1P62877 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBX1P62877 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBX1P62877 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBX1P62877 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms