Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCALDP61601 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCALDP61601 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCALDP61601 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCALDP61601 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCALDP61601 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCALDP61601 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCALDP61601 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCALDP61601 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCALDP61601 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCALDP61601 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCALDP61601 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCALDP61601 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCALDP61601 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCALDP61601 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCALDP61601 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCALDP61601 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCALDP61601 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCALDP61601 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCALDP61601 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCALDP61601 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCALDP61601 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCALDP61601 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCALDP61601 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCALDP61601 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCALDP61601 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCALDP61601 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCALDP61601 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCALDP61601 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCALDP61601 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCALDP61601 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCALDP61601 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCALDP61601 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCALDP61601 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCALDP61601 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCALDP61601 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCALDP61601 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCALDP61601 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCALDP61601 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCALDP61601 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCALDP61601 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCALDP61601 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCALDP61601 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCALDP61601 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCALDP61601 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCALDP61601 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCALDP61601 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCALDP61601 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCALDP61601 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCALDP61601 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCALDP61601 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCALDP61601 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCALDP61601 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCALDP61601 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCALDP61601 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCALDP61601 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCALDP61601 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCALDP61601 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCALDP61601 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCALDP61601 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCALDP61601 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCALDP61601 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCALDP61601 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCALDP61601 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCALDP61601 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCALDP61601 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms