Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLCSP50747 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLCSP50747 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLCSP50747 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLCSP50747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLCSP50747 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLCSP50747 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLCSP50747 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLCSP50747 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLCSP50747 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLCSP50747 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HLCSP50747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HLCSP50747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLCSP50747 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLCSP50747 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLCSP50747 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLCSP50747 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HLCSP50747 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLCSP50747 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLCSP50747 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLCSP50747 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HLCSP50747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLCSP50747 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HLCSP50747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLCSP50747 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLCSP50747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLCSP50747 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLCSP50747 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLCSP50747 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLCSP50747 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLCSP50747 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLCSP50747 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLCSP50747 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLCSP50747 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLCSP50747 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLCSP50747 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLCSP50747 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLCSP50747 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms