Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRE11P49959 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRE11P49959 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRE11P49959 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRE11P49959 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRE11P49959 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MRE11P49959 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MRE11P49959 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRE11P49959 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRE11P49959 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRE11P49959 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRE11P49959 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRE11P49959 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRE11P49959 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRE11P49959 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRE11P49959 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRE11P49959 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRE11P49959 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
MRE11P49959 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRE11P49959 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRE11P49959 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRE11P49959 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRE11P49959 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRE11P49959 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MRE11P49959 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRE11P49959 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRE11P49959 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRE11P49959 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MRE11P49959 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MRE11P49959 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRE11P49959 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRE11P49959 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRE11P49959 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRE11P49959 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRE11P49959 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRE11P49959 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRE11P49959 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRE11P49959 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRE11P49959 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRE11P49959 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRE11P49959 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRE11P49959 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRE11P49959 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRE11P49959 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRE11P49959 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRE11P49959 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRE11P49959 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRE11P49959 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRE11P49959 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRE11P49959 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRE11P49959 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRE11P49959 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRE11P49959 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MRE11P49959 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRE11P49959 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRE11P49959 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRE11P49959 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRE11P49959 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MRE11P49959 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRE11P49959 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRE11P49959 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRE11P49959 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRE11P49959 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRE11P49959 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRE11P49959 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MRE11P49959 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MRE11P49959 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MRE11P49959 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MRE11P49959 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRE11P49959 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRE11P49959 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MRE11P49959 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms