Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNNT3P45378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNNT3P45378 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNNT3P45378 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNT3P45378 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNT3P45378 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms