Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP2P42575 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP2P42575 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP2P42575 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP2P42575 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP2P42575 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP2P42575 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP2P42575 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP2P42575 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP2P42575 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP2P42575 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASP2P42575 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASP2P42575 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP2P42575 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASP2P42575 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP2P42575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP2P42575 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP2P42575 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASP2P42575 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASP2P42575 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASP2P42575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP2P42575 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP2P42575 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP2P42575 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASP2P42575 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP2P42575 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASP2P42575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP2P42575 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASP2P42575 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP2P42575 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP2P42575 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP2P42575 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP2P42575 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASP2P42575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASP2P42575 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASP2P42575 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP2P42575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP2P42575 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP2P42575 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASP2P42575 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASP2P42575 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms