Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERPINF1P36955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SERPINF1P36955 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SERPINF1P36955 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms