Protein–RNA interactions for Protein: P33240

CSTF2, Cleavage stimulation factor subunit 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2P33240 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 28.8
CSTF2P33240 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-10■■■■■ 28.8
CSTF2P33240 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 58.06□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 26.94□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 LINC01473-201ENST00000419719 587 ntTSL 24.68□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.722e-8■■■■■ 28.7
CSTF2P33240 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 HECTD1-215ENST00000556474 1046 ntTSL 317.74■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 HECTD1-202ENST00000553616 570 ntTSL 24.42□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 28.6
CSTF2P33240 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.735e-9■■■■■ 28.5
CSTF2P33240 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 213□□□□□ -0.334e-13■■■■■ 28.5
CSTF2P33240 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 212.7□□□□□ -0.384e-13■■■■■ 28.5
CSTF2P33240 RBM39-230ENST00000476806 754 ntTSL 57.31□□□□□ -1.244e-13■■■■■ 28.5
CSTF2P33240 RBM39-240ENST00000495293 759 ntTSL 24.32□□□□□ -1.724e-13■■■■■ 28.5
CSTF2P33240 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 320.27■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 418.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ACSL4-207ENST00000504383 683 ntTSL 25.19□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.653e-8■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 SHC2-206ENST00000590222 951 ntTSL 516.73■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-10■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)22.15■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 28.4
CSTF2P33240 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.735e-7■■■■■ 28.3
CSTF2P33240 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 49.31□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 28.3
CSTF2P33240 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 32.59□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 28.3
CSTF2P33240 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.76□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.864e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.094e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.024e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.734e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 210.21□□□□□ -0.784e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-216ENST00000442834 2508 ntTSL 210.02□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.064e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 CHD6-205ENST00000440697 1635 ntTSL 58.2□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC8.08□□□□□ -1.124e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 CHD6-206ENST00000470470 1349 ntTSL 55.93□□□□□ -1.464e-10■■■■■ 28.2
CSTF2P33240 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-9■■■■■ 28.1
CSTF2P33240 NUPL2-207ENST00000485250 2010 ntTSL 516.35■□□□□ 0.215e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-203ENST00000413919 1329 ntTSL 313.64□□□□□ -0.235e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-204ENST00000437140 1285 ntTSL 512.4□□□□□ -0.425e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-205ENST00000438012 1653 ntTSL 211.95□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-201ENST00000258742 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-206ENST00000477844 2529 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.625e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-209ENST00000487595 623 ntTSL 311.19□□□□□ -0.625e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-212ENST00000548367 249 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.075e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 NUPL2-208ENST00000486136 350 ntTSL 23.26□□□□□ -1.895e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.085e-17■■■■■ 28
CSTF2P33240 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-17■■■■■ 28
CSTF2P33240 AC006001.2-203ENST00000428557 304 ntTSL 311.67□□□□□ -0.545e-17■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 DLG1-219ENST00000456699 629 ntTSL 38.49□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 DLG1-218ENST00000453607 539 ntTSL 44.01□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 DLG1-203ENST00000392380 716 ntTSL 33.95□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 28
CSTF2P33240 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.774e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 SIAH1-201ENST00000356721 2415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.17□□□□□ -1.584e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-207ENST00000395914 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-206ENST00000395913 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-10■■■■■ 28
CSTF2P33240 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-9■■■■■ 28
CSTF2P33240 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 28
Retrieved 100 of 6,735 protein–RNA pairs in 96 ms