Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CXCR5P32302 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CXCR5P32302 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CXCR5P32302 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCR5P32302 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCR5P32302 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms