Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP4AP20648 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP4AP20648 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP4AP20648 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP4AP20648 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP4AP20648 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP4AP20648 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms