Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT15P19012 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT15P19012 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT15P19012 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT15P19012 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT15P19012 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT15P19012 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT15P19012 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT15P19012 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT15P19012 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT15P19012 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT15P19012 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT15P19012 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT15P19012 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT15P19012 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT15P19012 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT15P19012 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT15P19012 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT15P19012 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT15P19012 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT15P19012 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT15P19012 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT15P19012 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT15P19012 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT15P19012 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT15P19012 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT15P19012 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT15P19012 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT15P19012 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT15P19012 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT15P19012 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT15P19012 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT15P19012 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT15P19012 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT15P19012 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT15P19012 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT15P19012 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT15P19012 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT15P19012 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT15P19012 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT15P19012 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT15P19012 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT15P19012 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT15P19012 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT15P19012 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT15P19012 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT15P19012 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT15P19012 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT15P19012 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT15P19012 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT15P19012 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT15P19012 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT15P19012 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT15P19012 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT15P19012 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT15P19012 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT15P19012 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT15P19012 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT15P19012 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT15P19012 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT15P19012 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT15P19012 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT15P19012 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT15P19012 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT15P19012 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT15P19012 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT15P19012 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms