Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXB4P17483 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXB4P17483 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXB4P17483 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXB4P17483 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms