Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LYL1P12980 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LYL1P12980 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYL1P12980 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LYL1P12980 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LYL1P12980 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LYL1P12980 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYL1P12980 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LYL1P12980 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYL1P12980 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYL1P12980 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LYL1P12980 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYL1P12980 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYL1P12980 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYL1P12980 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LYL1P12980 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LYL1P12980 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYL1P12980 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYL1P12980 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYL1P12980 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LYL1P12980 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYL1P12980 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYL1P12980 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LYL1P12980 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LYL1P12980 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYL1P12980 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYL1P12980 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYL1P12980 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LYL1P12980 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYL1P12980 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LYL1P12980 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYL1P12980 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYL1P12980 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYL1P12980 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LYL1P12980 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYL1P12980 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYL1P12980 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYL1P12980 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYL1P12980 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LYL1P12980 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYL1P12980 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYL1P12980 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LYL1P12980 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYL1P12980 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYL1P12980 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYL1P12980 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYL1P12980 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYL1P12980 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYL1P12980 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYL1P12980 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LYL1P12980 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYL1P12980 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYL1P12980 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYL1P12980 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYL1P12980 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYL1P12980 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYL1P12980 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYL1P12980 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LYL1P12980 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYL1P12980 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYL1P12980 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYL1P12980 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYL1P12980 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms