Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM13P0DJ93 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM13P0DJ93 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM13P0DJ93 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1263.5 ms