Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNA1O75449 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KATNA1O75449 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KATNA1O75449 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KATNA1O75449 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KATNA1O75449 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms