Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNOT3O75175 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNOT3O75175 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CNOT3O75175 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CNOT3O75175 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms