Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX1O43435 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX1O43435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBX1O43435 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TBX1O43435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX1O43435 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBX1O43435 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBX1O43435 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX1O43435 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX1O43435 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBX1O43435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBX1O43435 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBX1O43435 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX1O43435 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX1O43435 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBX1O43435 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBX1O43435 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBX1O43435 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TBX1O43435 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBX1O43435 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBX1O43435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBX1O43435 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBX1O43435 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBX1O43435 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBX1O43435 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX1O43435 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX1O43435 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBX1O43435 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX1O43435 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX1O43435 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBX1O43435 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX1O43435 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX1O43435 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX1O43435 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBX1O43435 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBX1O43435 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TBX1O43435 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBX1O43435 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX1O43435 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX1O43435 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms