Protein–RNA interactions for Protein: O15480

MAGEB3, Melanoma-associated antigen B3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEB3O15480 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEB3O15480 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAGEB3O15480 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEB3O15480 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEB3O15480 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms