Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRTO14522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRTO14522 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRTO14522 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PTPRTO14522 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PTPRTO14522 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
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