Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KRW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
J3KRW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KRW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KRW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KRW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KRW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
J3KRW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
J3KRW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KRW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KRW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KRW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KRW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
J3KRW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
J3KRW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3KRW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3KRW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KRW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KRW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KRW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KRW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3KRW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3KRW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KRW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KRW8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KRW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KRW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3KRW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KRW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KRW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3KRW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KRW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KRW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3KRW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KRW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
J3KRW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
J3KRW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
J3KRW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
J3KRW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KRW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KRW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
J3KRW8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KRW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KRW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
J3KRW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KRW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KRW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
J3KRW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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