Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00862A6NCI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC00862A6NCI5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00862A6NCI5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00862A6NCI5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms