Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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EXT1Q16394 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EXT1Q16394 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms