Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.212e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 RPL10-216ENST00000491035 1369 ntTSL 513.35□□□□□ -0.272e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 RPL10-211ENST00000467168 802 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 RPL10-201ENST00000344746 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.362e-18■□□□□ 8.6
G3BP1Q13283 COASY-209ENST00000588353 387 ntTSL 320.15■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 8.6
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G3BP1Q13283 UQCRC2-206ENST00000564095 542 ntTSL 44.38□□□□□ -1.711e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ACSL3-207ENST00000474422 760 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-14■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.211e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.071e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-204ENST00000595231 1673 ntTSL 1 (best)27.96■■■□□ 2.071e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-209ENST00000601065 1757 ntTSL 327.3■■□□□ 1.961e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 NDUFS2-208ENST00000478866 1076 ntTSL 224.25■■□□□ 1.471e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-202ENST00000401730 3144 ntTSL 220.46■□□□□ 0.871e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.651e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DCAF7-203ENST00000580091 325 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ACSS3-204ENST00000548324 2214 ntTSL 29.79□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.667e-36■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 210.14□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 210.07□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.243e-9■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.348e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.28e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.968e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.771e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 57.27□□□□□ -1.251e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 27.21□□□□□ -1.261e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 56.45□□□□□ -1.381e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 25.97□□□□□ -1.451e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 533.39■■■□□ 2.943e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 433.07■■■□□ 2.883e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.53e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 227.7■■■□□ 2.023e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CES1-208ENST00000566555 659 ntTSL 326.01■■□□□ 1.753e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.533e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 422.67■■□□□ 1.223e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CES1-206ENST00000565403 540 ntTSL 522.48■■□□□ 1.193e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 UNC45A-215ENST00000557212 1528 ntTSL 222.34■■□□□ 1.173e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CAPRIN1-217ENST00000534825 668 ntTSL 322.16■■□□□ 1.143e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 COLGALT1-203ENST00000597075 737 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 UNC45A-210ENST00000553671 855 ntTSL 320.46■□□□□ 0.873e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 420.36■□□□□ 0.853e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CAPRIN1-204ENST00000526494 399 ntTSL 419.65■□□□□ 0.743e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.573e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.53e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 317.89■□□□□ 0.453e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 COLGALT1-204ENST00000597147 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.16■□□□□ 0.343e-7■□□□□ 8.5
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G3BP1Q13283 CES1-204ENST00000563005 1002 ntTSL 516.37■□□□□ 0.213e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 216.32■□□□□ 0.23e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 GPS1-215ENST00000581578 470 ntTSL 416.19■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AAMP-206ENST00000461911 567 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AC068631.2-201ENST00000418776 501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DDX6-201ENST00000525082 1232 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.413e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ADAR-203ENST00000463920 2347 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-11■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AC104109.4-201ENST00000520515 1744 ntTSL 29.29□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.023e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 48.26□□□□□ -1.093e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.143e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.163e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 HNRNPR-205ENST00000463552 837 ntTSL 47.69□□□□□ -1.183e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 HNRNPR-208ENST00000476451 814 ntTSL 47.44□□□□□ -1.223e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.373e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 FUBP1-205ENST00000470287 726 ntTSL 33.69□□□□□ -1.823e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 IMMT-208ENST00000460081 424 ntTSL 23.41□□□□□ -1.863e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.873e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CAPRIN1-214ENST00000533641 429 ntTSL 42.99□□□□□ -1.933e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AHCTF1-206ENST00000483900 3451 ntTSL 22.64□□□□□ -1.993e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 AHCTF1-203ENST00000470300 7041 ntTSL 1 (best)1.65□□□□□ -2.143e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-217ENST00000478183 1818 ntTSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.555e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-213ENST00000473102 575 ntTSL 59.01□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-218ENST00000484294 500 ntTSL 59.01□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-210ENST00000465834 957 ntTSL 38.65□□□□□ -1.025e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-212ENST00000470533 798 ntTSL 56.44□□□□□ -1.385e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-211ENST00000467616 676 ntTSL 56.36□□□□□ -1.395e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-219ENST00000491794 995 ntTSL 25.86□□□□□ -1.475e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 SON-216ENST00000477419 771 ntTSL 23.34□□□□□ -1.875e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.665e-8■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 YIF1A-209ENST00000494836 540 ntTSL 220.13■□□□□ 0.811e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 YIF1A-208ENST00000485820 653 ntTSL 218.57■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 ATP5G3-204ENST00000472782 686 ntTSL 218.43■□□□□ 0.541e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 YIF1A-211ENST00000526497 516 ntTSL 517.74■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 52.78□□□□□ -1.961e-7■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 LYZ-201ENST00000261267 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.741e-323■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-323■□□□□ 8.5
G3BP1Q13283 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.791e-323■□□□□ 8.5
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