RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.5■■■■■ 8.08
BRD4-208ENST00000597315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.34■■■■■ 6.93
BRD4-208ENST00000597315 ABCC9O60706 1549 aa57.4■■■■■ 6.78
BRD4-208ENST00000597315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.11■■■■■ 6.41
BRD4-208ENST00000597315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.08■■■■■ 6.41
BRD4-208ENST00000597315 NACADO15069 1562 aa54.95■■■■■ 6.39
BRD4-208ENST00000597315 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.48■■■■■ 6.31
BRD4-208ENST00000597315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.47■■■■■ 6.31
BRD4-208ENST00000597315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.15■■■■■ 6.26
BRD4-208ENST00000597315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.71■■■■■ 6.19
BRD4-208ENST00000597315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.63■■■■■ 6.18
BRD4-208ENST00000597315 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.3■■■■■ 6.12
BRD4-208ENST00000597315 SCRIBQ14160 1630 aa53.26■■■■■ 6.12
BRD4-208ENST00000597315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.82■■■■■ 6.05
BRD4-208ENST00000597315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.82■■■■■ 6.05
BRD4-208ENST00000597315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52■■■■■ 5.92
BRD4-208ENST00000597315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.86■■■■■ 5.89
BRD4-208ENST00000597315 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.61■■■■■ 5.85
BRD4-208ENST00000597315 SMARCA4P51532 1647 aa50.87■■■■■ 5.73
BRD4-208ENST00000597315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.83■■■■■ 5.73
BRD4-208ENST00000597315 NCAPD3P42695 1498 aa50.68■■■■■ 5.7
BRD4-208ENST00000597315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.67■■■■■ 5.7
BRD4-208ENST00000597315 SMARCA2P51531 1590 aa50.66■■■■■ 5.7
BRD4-208ENST00000597315 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.45■■■■■ 5.67
BRD4-208ENST00000597315 HMGXB3Q12766 1538 aa50.41■■■■■ 5.66
BRD4-208ENST00000597315 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.33■■■■■ 5.65
BRD4-208ENST00000597315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
BRD4-208ENST00000597315 WIZO95785 1651 aa49.91■■■■■ 5.58
BRD4-208ENST00000597315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.8■■■■■ 5.56
BRD4-208ENST00000597315 ERCC6Q03468 1493 aa49.6■■■■■ 5.53
BRD4-208ENST00000597315 NESP48681 1621 aa49.54■■■■■ 5.52
BRD4-208ENST00000597315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.42■■■■■ 5.5
BRD4-208ENST00000597315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
BRD4-208ENST00000597315 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.24■■■■■ 5.47
BRD4-208ENST00000597315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.17■■■■■ 5.46
BRD4-208ENST00000597315 CUX2O14529 1486 aa49.07■■■■■ 5.45
BRD4-208ENST00000597315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.94■■■■■ 5.43
BRD4-208ENST00000597315 CFTRP13569 1480 aa48.85■■■■■ 5.41
BRD4-208ENST00000597315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
BRD4-208ENST00000597315 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.8■■■■■ 5.4
BRD4-208ENST00000597315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.79■■■■■ 5.4
BRD4-208ENST00000597315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.68■■■■■ 5.38
BRD4-208ENST00000597315 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.67■■■■■ 5.38
BRD4-208ENST00000597315 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.63■■■■■ 5.38
BRD4-208ENST00000597315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
BRD4-208ENST00000597315 PRDM2Q13029 1718 aa48.44■■■■■ 5.34
BRD4-208ENST00000597315 WDR62O43379 1518 aa48.42■■■■■ 5.34
BRD4-208ENST00000597315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
BRD4-208ENST00000597315 ABCC8Q09428 1581 aa47.9■■■■■ 5.26
BRD4-208ENST00000597315 TOPBP1Q92547 1522 aa47.84■■■■■ 5.25
BRD4-208ENST00000597315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.78■■■■■ 5.24
BRD4-208ENST00000597315 IFT140Q96RY7 1462 aa47.65■■■■■ 5.22
BRD4-208ENST00000597315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
BRD4-208ENST00000597315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
BRD4-208ENST00000597315 CUX1P39880 1505 aa47.35■■■■■ 5.17
BRD4-208ENST00000597315 SOGA1O94964 1423 aa47.29■■■■■ 5.16
BRD4-208ENST00000597315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.28■■■■■ 5.16
BRD4-208ENST00000597315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
BRD4-208ENST00000597315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.22■■■■■ 5.15
BRD4-208ENST00000597315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
BRD4-208ENST00000597315 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.149e-7■■■■□ 21.9
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BRD4-208ENST00000597315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.05■■■■■ 5.12
BRD4-208ENST00000597315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
BRD4-208ENST00000597315 WDR97A6NE52 1622 aa46.96■■■■■ 5.11
BRD4-208ENST00000597315 TOP2BQ02880 1626 aa46.9■■■■■ 5.1
BRD4-208ENST00000597315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.87■■■■■ 5.09
BRD4-208ENST00000597315 SYNJ1O43426 1573 aa46.85■■■■■ 5.09
BRD4-208ENST00000597315 FBLN2P98095 1184 aa46.8■■■■■ 5.08
BRD4-208ENST00000597315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.79■■■■■ 5.08
BRD4-208ENST00000597315 GRIN2BQ13224 1484 aa46.76■■■■■ 5.08
BRD4-208ENST00000597315 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.72■■■■■ 5.07
BRD4-208ENST00000597315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.7■■■■■ 5.07
BRD4-208ENST00000597315 CHD1O14646 1710 aa46.66■■■■■ 5.06
BRD4-208ENST00000597315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
BRD4-208ENST00000597315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.6■■■■■ 5.05
BRD4-208ENST00000597315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.59■■■■■ 5.05
BRD4-208ENST00000597315 PBRM1Q86U86 1689 aa46.59■■■■■ 5.05
BRD4-208ENST00000597315 SYNJ2O15056 1496 aa46.46■■■■■ 5.03
BRD4-208ENST00000597315 TRIM41Q8WV44 630 aa46.32■■■■■ 5.01
BRD4-208ENST00000597315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.25■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.23■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 ARHGEF11O15085 1522 aa46.21■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 ADAMTS12P58397 1594 aa46.19■■■■■ 4.99
BRD4-208ENST00000597315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.17■■■■■ 4.98
BRD4-208ENST00000597315 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.12■■■■■ 4.97
BRD4-208ENST00000597315 GRIN2AQ12879 1464 aa46.12■■■■■ 4.97
BRD4-208ENST00000597315 KIF27Q86VH2 1401 aa46.11■■■■■ 4.97
BRD4-208ENST00000597315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.91■■■■■ 4.94
BRD4-208ENST00000597315 NUP160Q12769 1436 aa45.88■■■■■ 4.94
BRD4-208ENST00000597315 IGF1RP08069 1367 aa45.87■■■■■ 4.93
BRD4-208ENST00000597315 CEP170Q5SW79 1584 aa45.86■■■■■ 4.93
BRD4-208ENST00000597315 ARAP1Q96P48 1450 aa45.8■■■■■ 4.92
BRD4-208ENST00000597315 CUL7Q14999 1698 aa45.79■■■■■ 4.92
BRD4-208ENST00000597315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.66■■■■■ 4.9
BRD4-208ENST00000597315 SHROOM2Q13796 1616 aa45.53■■■■■ 4.88
BRD4-208ENST00000597315 JPH4Q96JJ6 628 aa45.52■■■■■ 4.88
BRD4-208ENST00000597315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.51■■■■■ 4.88
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