RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477596.1

SF1-214, Transcript of splicing factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene SF1, Length 802 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1-214ENST00000477596 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.62■■■■■ 6.33
SF1-214ENST00000477596 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.58■■■■■ 5.37
SF1-214ENST00000477596 ABCC9O60706 1549 aa47.69■■■■■ 5.22
SF1-214ENST00000477596 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.75■■■■■ 4.91
SF1-214ENST00000477596 NACADO15069 1562 aa45.66■■■■■ 4.9
SF1-214ENST00000477596 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.64■■■■■ 4.9
SF1-214ENST00000477596 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
SF1-214ENST00000477596 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.31■■■■■ 4.84
SF1-214ENST00000477596 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.12■■■■■ 4.81
SF1-214ENST00000477596 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.83■■■■■ 4.77
SF1-214ENST00000477596 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.53■■■■■ 4.72
SF1-214ENST00000477596 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.46■■■■■ 4.71
SF1-214ENST00000477596 SCRIBQ14160 1630 aa44.43■■■■■ 4.7
SF1-214ENST00000477596 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.83■■■■■ 4.61
SF1-214ENST00000477596 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.83■■■■■ 4.61
SF1-214ENST00000477596 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
SF1-214ENST00000477596 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.11■■■■■ 4.49
SF1-214ENST00000477596 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.81■■■■■ 4.44
SF1-214ENST00000477596 SMARCA4P51532 1647 aa42.44■■■■■ 4.38
SF1-214ENST00000477596 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
SF1-214ENST00000477596 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.19■■■■■ 4.34
SF1-214ENST00000477596 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.16■■■■■ 4.34
SF1-214ENST00000477596 NCAPD3P42695 1498 aa42.12■■■■■ 4.33
SF1-214ENST00000477596 SMARCA2P51531 1590 aa42.1■■■■■ 4.33
SF1-214ENST00000477596 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.97■■■■■ 4.31
SF1-214ENST00000477596 HMGXB3Q12766 1538 aa41.95■■■■■ 4.31
SF1-214ENST00000477596 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
SF1-214ENST00000477596 WIZO95785 1651 aa41.71■■■■■ 4.27
SF1-214ENST00000477596 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SF1-214ENST00000477596 NESP48681 1621 aa41.28■■■■■ 4.2
SF1-214ENST00000477596 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
SF1-214ENST00000477596 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.05■■■■■ 4.16
SF1-214ENST00000477596 ERCC6Q03468 1493 aa41.05■■■■■ 4.16
SF1-214ENST00000477596 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.9■■■■■ 4.14
SF1-214ENST00000477596 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.78■■■■■ 4.12
SF1-214ENST00000477596 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.73■■■■■ 4.11
SF1-214ENST00000477596 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.72■■■■■ 4.11
SF1-214ENST00000477596 CFTRP13569 1480 aa40.67■■■■■ 4.1
SF1-214ENST00000477596 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
SF1-214ENST00000477596 CUX2O14529 1486 aa40.6■■■■■ 4.09
SF1-214ENST00000477596 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
SF1-214ENST00000477596 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.49■■■■■ 4.07
SF1-214ENST00000477596 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
SF1-214ENST00000477596 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.39■■■■■ 4.06
SF1-214ENST00000477596 PRDM2Q13029 1718 aa40.39■■■■■ 4.06
SF1-214ENST00000477596 WDR62O43379 1518 aa40.28■■■■■ 4.04
SF1-214ENST00000477596 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
SF1-214ENST00000477596 TOPBP1Q92547 1522 aa39.85■■■■□ 3.97
SF1-214ENST00000477596 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.78■■■■□ 3.96
SF1-214ENST00000477596 ABCC8Q09428 1581 aa39.7■■■■□ 3.95
SF1-214ENST00000477596 IFT140Q96RY7 1462 aa39.56■■■■□ 3.92
SF1-214ENST00000477596 CUX1P39880 1505 aa39.55■■■■□ 3.92
SF1-214ENST00000477596 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
SF1-214ENST00000477596 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
SF1-214ENST00000477596 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
SF1-214ENST00000477596 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.42■■■■□ 3.9
SF1-214ENST00000477596 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.41■■■■□ 3.9
SF1-214ENST00000477596 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.37■■■■□ 3.89
SF1-214ENST00000477596 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
SF1-214ENST00000477596 SOGA1O94964 1423 aa39.28■■■■□ 3.88
SF1-214ENST00000477596 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.22■■■■□ 3.874e-14■■■■■ 56.9
SF1-214ENST00000477596 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.21■■■■□ 3.87
SF1-214ENST00000477596 SYNJ1O43426 1573 aa39.21■■■■□ 3.87
SF1-214ENST00000477596 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.16■■■■□ 3.86
SF1-214ENST00000477596 TOP2BQ02880 1626 aa39.14■■■■□ 3.86
SF1-214ENST00000477596 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SF1-214ENST00000477596 WDR97A6NE52 1622 aa39.12■■■■□ 3.85
SF1-214ENST00000477596 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.98■■■■□ 3.83
SF1-214ENST00000477596 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.89■■■■□ 3.82
SF1-214ENST00000477596 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.87■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 CHD1O14646 1710 aa38.86■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.86■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 OSCARQ8IYS5 282 aa38.85■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 GRIN2BQ13224 1484 aa38.85■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 PBRM1Q86U86 1689 aa38.84■■■■□ 3.81
SF1-214ENST00000477596 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.74■■■■□ 3.79
SF1-214ENST00000477596 FBLN2P98095 1184 aa38.71■■■■□ 3.79
SF1-214ENST00000477596 SYNJ2O15056 1496 aa38.6■■■■□ 3.77
SF1-214ENST00000477596 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
SF1-214ENST00000477596 ADAMTS12P58397 1594 aa38.53■■■■□ 3.76
SF1-214ENST00000477596 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.49■■■■□ 3.75
SF1-214ENST00000477596 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.4■■■■□ 3.74
SF1-214ENST00000477596 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.38■■■■□ 3.74
SF1-214ENST00000477596 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.38■■■■□ 3.74
SF1-214ENST00000477596 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.38■■■■□ 3.74
SF1-214ENST00000477596 GRIN2AQ12879 1464 aa38.38■■■■□ 3.73
SF1-214ENST00000477596 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.38■■■■□ 3.73
SF1-214ENST00000477596 KIF27Q86VH2 1401 aa38.36■■■■□ 3.73
SF1-214ENST00000477596 ARHGEF11O15085 1522 aa38.35■■■■□ 3.73
SF1-214ENST00000477596 CEP170Q5SW79 1584 aa38.24■■■■□ 3.71
SF1-214ENST00000477596 IGF1RP08069 1367 aa38.23■■■■□ 3.71
SF1-214ENST00000477596 NUP160Q12769 1436 aa38.2■■■■□ 3.71
SF1-214ENST00000477596 TRIM41Q8WV44 630 aa38.19■■■■□ 3.7
SF1-214ENST00000477596 CUL7Q14999 1698 aa38.15■■■■□ 3.7
SF1-214ENST00000477596 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.12■■■■□ 3.69
SF1-214ENST00000477596 ARAP1Q96P48 1450 aa38.07■■■■□ 3.68
SF1-214ENST00000477596 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.99■■■■□ 3.67
SF1-214ENST00000477596 SHROOM2Q13796 1616 aa37.94■■■■□ 3.66
SF1-214ENST00000477596 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.94■■■■□ 3.66
SF1-214ENST00000477596 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.94■■■■□ 3.66
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