Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms