Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
J3KRW8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
J3KRW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
J3KRW8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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