Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC24CP53992 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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