RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.74■■■□□ 2.51
NFE2L3-201ENST00000056233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3-201ENST00000056233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.01■■■□□ 2.23
NFE2L3-201ENST00000056233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.54■■■□□ 2.16
NFE2L3-201ENST00000056233 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.15■■■□□ 2.1
NFE2L3-201ENST00000056233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
NFE2L3-201ENST00000056233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.68■■■□□ 2.02
NFE2L3-201ENST00000056233 HRCP23327 699 aa27.67■■■□□ 2.02
NFE2L3-201ENST00000056233 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.31■■□□□ 1.96
NFE2L3-201ENST00000056233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.28■■□□□ 1.96
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
NFE2L3-201ENST00000056233 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.83■■□□□ 1.89
NFE2L3-201ENST00000056233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM41Q8WV44 630 aa26.47■■□□□ 1.83
NFE2L3-201ENST00000056233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NFE2L3-201ENST00000056233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NFE2L3-201ENST00000056233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3-201ENST00000056233 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NFE2L3-201ENST00000056233 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NFE2L3-201ENST00000056233 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NFE2L3-201ENST00000056233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.88■■□□□ 1.73
NFE2L3-201ENST00000056233 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.86■■□□□ 1.73
NFE2L3-201ENST00000056233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NFE2L3-201ENST00000056233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
NFE2L3-201ENST00000056233 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
NFE2L3-201ENST00000056233 NEUROD1Q13562 356 aa25.74■■□□□ 1.71
NFE2L3-201ENST00000056233 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
NFE2L3-201ENST00000056233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.31■■□□□ 1.64
NFE2L3-201ENST00000056233 APLP2Q06481 763 aa25.29■■□□□ 1.64
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NFE2L3-201ENST00000056233 MYT1Q01538 1121 aa25.08■■□□□ 1.61
NFE2L3-201ENST00000056233 MIER1Q8N108 512 aa25■■□□□ 1.59
NFE2L3-201ENST00000056233 ITGAEP38570 1179 aa24.99■■□□□ 1.59
NFE2L3-201ENST00000056233 SCRIBQ14160 1630 aa24.98■■□□□ 1.59
NFE2L3-201ENST00000056233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NFE2L3-201ENST00000056233 BCANQ96GW7 911 aa24.93■■□□□ 1.58
NFE2L3-201ENST00000056233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.74■■□□□ 1.55
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCC9O60706 1549 aa24.71■■□□□ 1.55
NFE2L3-201ENST00000056233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NFE2L3-201ENST00000056233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.63■■□□□ 1.53
NFE2L3-201ENST00000056233 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.55■■□□□ 1.52
NFE2L3-201ENST00000056233 CEP162Q5TB80 1403 aa24.49■■□□□ 1.51
NFE2L3-201ENST00000056233 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
NFE2L3-201ENST00000056233 NEFLP07196 543 aa24.48■■□□□ 1.51
NFE2L3-201ENST00000056233 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.39■■□□□ 1.5
NFE2L3-201ENST00000056233 SOGA1O94964 1423 aa24.34■■□□□ 1.49
NFE2L3-201ENST00000056233 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NFE2L3-201ENST00000056233 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NFE2L3-201ENST00000056233 FKBP8Q14318 412 aa24.31■■□□□ 1.48
NFE2L3-201ENST00000056233 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NFE2L3-201ENST00000056233 ABCC8Q09428 1581 aa24.27■■□□□ 1.48
NFE2L3-201ENST00000056233 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.25■■□□□ 1.47
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.23■■□□□ 1.47
NFE2L3-201ENST00000056233 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3-201ENST00000056233 TRIM52Q96A61 297 aa24.22■■□□□ 1.47
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NFE2L3-201ENST00000056233 KCNH8Q96L42 1107 aa24.14■■□□□ 1.45
NFE2L3-201ENST00000056233 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.09■■□□□ 1.45
NFE2L3-201ENST00000056233 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.09■■□□□ 1.45
NFE2L3-201ENST00000056233 WIZO95785 1651 aa24.08■■□□□ 1.45
NFE2L3-201ENST00000056233 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
NFE2L3-201ENST00000056233 CLIP1P30622 1438 aa24.07■■□□□ 1.44
NFE2L3-201ENST00000056233 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.03■■□□□ 1.44
NFE2L3-201ENST00000056233 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.02■■□□□ 1.44
NFE2L3-201ENST00000056233 P3H3Q8IVL6 736 aa24.02■■□□□ 1.43
NFE2L3-201ENST00000056233 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.93■■□□□ 1.42
NFE2L3-201ENST00000056233 GOLGA3Q08378 1498 aa23.92■■□□□ 1.42
NFE2L3-201ENST00000056233 ANP32CO43423 234 aa23.9■■□□□ 1.42
NFE2L3-201ENST00000056233 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.87■■□□□ 1.41
NFE2L3-201ENST00000056233 BCL11AQ9H165 835 aa23.87■■□□□ 1.41
NFE2L3-201ENST00000056233 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
NFE2L3-201ENST00000056233 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.8■■□□□ 1.4
NFE2L3-201ENST00000056233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
NFE2L3-201ENST00000056233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
NFE2L3-201ENST00000056233 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3-201ENST00000056233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
NFE2L3-201ENST00000056233 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NFE2L3-201ENST00000056233 EEA1Q15075 1411 aa23.65■■□□□ 1.38
NFE2L3-201ENST00000056233 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.63■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.63■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 NBR1Q14596 966 aa23.62■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.6■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 ARID3CA6NKF2 412 aa23.58■■□□□ 1.37
NFE2L3-201ENST00000056233 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.54■■□□□ 1.36
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NFE2L3-201ENST00000056233 TONSLQ96HA7 1378 aa23.47■■□□□ 1.35
NFE2L3-201ENST00000056233 NACADO15069 1562 aa23.45■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.44■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.43■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.4■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.39■■□□□ 1.34
NFE2L3-201ENST00000056233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NFE2L3-201ENST00000056233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms