Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DYNC1LI1Q9Y6G9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI1Q9Y6G9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms