Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP4B1Q9Y6B7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP4B1Q9Y6B7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP4B1Q9Y6B7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms