Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR3HQ9Y535 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR3HQ9Y535 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR3HQ9Y535 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3HQ9Y535 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms