Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE7

STUB1, E3 ubiquitin-protein ligase CHIP, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STUB1Q9UNE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STUB1Q9UNE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STUB1Q9UNE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STUB1Q9UNE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STUB1Q9UNE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STUB1Q9UNE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STUB1Q9UNE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STUB1Q9UNE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STUB1Q9UNE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms