Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO4Q9UKT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FBXO4Q9UKT5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO4Q9UKT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO4Q9UKT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO4Q9UKT5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1675.4 ms