Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF20Q9UGU0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF20Q9UGU0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF20Q9UGU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms