Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNA9Q9UGM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA9Q9UGM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA9Q9UGM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 708.3 ms