Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMCD1Q9NZU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMCD1Q9NZU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMCD1Q9NZU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMCD1Q9NZU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms