Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF275Q9NSD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF275Q9NSD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF275Q9NSD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF275Q9NSD4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms