Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIMMDC1Q9NPL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms