Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C10orf88Q9H8K7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C10orf88Q9H8K7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C10orf88Q9H8K7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C10orf88Q9H8K7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 938 ms