Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRMDAQ9H2I8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRMDAQ9H2I8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRMDAQ9H2I8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRMDAQ9H2I8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRMDAQ9H2I8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms