Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NLRP1Q9C000 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NLRP1Q9C000 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
NLRP1Q9C000 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NLRP1Q9C000 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NLRP1Q9C000 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms