Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRNT1Q96Q11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNT1Q96Q11 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNT1Q96Q11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNT1Q96Q11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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