Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
YIPF6Q96EC8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YIPF6Q96EC8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF6Q96EC8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF6Q96EC8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms