Protein–RNA interactions for Protein: Q96DH6

MSI2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2Q96DH6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSI2Q96DH6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSI2Q96DH6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MSI2Q96DH6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MSI2Q96DH6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms