Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCN3Q96D15 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCN3Q96D15 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RCN3Q96D15 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RCN3Q96D15 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms