Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
OPTNQ96CV9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
OPTNQ96CV9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
OPTNQ96CV9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
OPTNQ96CV9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OPTNQ96CV9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms